ADAPT - Éditions

La génomique

Magali Fuchs-Gallezot, Maryline Coquidé-Cantor, Stéphane Tirard — 2023-05-27T11:52:09Z

Cet ouvrage vise à questionner, actualiser et éclairer les dimensions scientifiques, éthiques et politiques de la recherche en génétique pour favoriser la compréhension des enjeux et des débats liés à l'étude du génome. Son objectif est également d'aider les enseignants et leurs formateurs dans leur réflexion et dans leurs actions, afin qu'ils ne soient pas démunis face à une nouvelle approche de la génétique qui s'impose par souci de rigueur scientifique et par ses enjeux sociaux, mais qui est aussi plus délicate à enseigner…

La génomique, science qui étudie le matériel génétique d'un individu ou d'uen espèce, est est très présente dans les médias français à travers les avancées scientifiques spectaculaires mais ausssi les questions de la brevetabilité du vivant, de la médecine curative et prédictive, de l'utilisation des tests génétiques... Elle est devenue source d'interrogations, d'espoirs et de craintes au sein de la société.

Dans le même temps, l'enseignement de la biologie reste tiraillé entre deux approches qui peuvent paraître contradictoires. Une première approche, issue de la biologie moléculaire triomphante des années 1950 à 1980 et réductionniste, offrait une définition claire du gène et de ses fonctions, exposant des déterminismes simples, et donc rassurants, pour le pédagogue ou l'étudiant. Ses prétendues explications alimentent encore une certaine presse qui continue à annoncer la découverte du « gène » de la « fidélité », de la « dyslexie » voire de « l'intelligence ».

Une seconde approche, issue de la postgénomique, a fondamentalement remis en question les « dogmes » antérieurs, à commencer par la notion de gène. Elle resitue l'expression du génome et la réalisation du développement dans un réseau d'interactions où l'environnement, y compris cellulaire, n'est plus un acteur mineur. Plus délicate à enseigner, surtout quand on a été formé à « l'ancienne vision », cette biologie s'impose par souci de rigueur scientifique et aussi par ses enjeux sociaux. La génétique est passée d'un stade de description à un stade d'explication et d'intervention au niveau moléculaire. Pour permettre aux citoyens d'appréhender, de façon critique, les retombées de la recherche, l'enseignement a introduit de nouveaux contenus, avec un point de vue renouvelé sur la génétique et le vivant, et des dispositifs pédagogiques visant à développer le débat.

Les enseignants et les médiateurs scientifiques peuvent cependant se trouver démuni face à ces nouvelles perspectives. Cet ouvrage, issu d'un séminaire réunissant enseignants, scientifiques, didacticiens, historiens et philosophes de la biologie, vise à questionner, actualiser et éclairer les dimensions scientifiques, éthiques et politiques de la recherche en génétique et de ses applications ainsi que leurs articulations. Nous espérons qu'il puisse ainsi aider les formateurs dans leur réflexion et dans leurs actions.

Histoire de la vie latente

Stéphane Tirard — 2010-12-01T09:21:00Z

– Au XVIII° siècle, quand des organismes, ayant perdu toute activité caractéristique du vivant , "revivent" en présence d'eau... on est conduit à des interrogations fondamentales sur la notion de vie. Et aujourd'hui on exploite cette vie latente en allant jusqu'à congeler nos propres embryons... ce qui produti une nouvelle réflexion tant scientifique qu'éthique.

– Les graines, les mousses, les bactéries mais aussi de petits invertébrés comme les tardigrades et les rotifères sont capables d'entrer dans un état – dit amétabolique – où ils ne présentent plus la moindre trace d'activité. Cette singulière propriété a reçu le nom de vie latente.

On sait aujourd'hui l'appliquer en laboratoire puisque, par exemple, les méthodes de cryoconservation utilisées pour congeler embryons et spermatozoïdes consistent, en fait, à les placer en état de vie latente.
Bien qu'il soit hautement original, ce problème de biologie n'a encore été que très peu exploré par l'histoire des sciences. Pourtant, les premières observations d'organismes capables d'entrer en vie latente et de « ressusciter » (comme on disait
à l'époque) remontent au XVIIIe siècle ; au lendemain des travaux pionniers du Hollandais Antoni van Leeuwenhoeck, elles entraînèrent de houleux débats auxquels participèrent notamment l'Anglais John Needham et l'Italien Lazarro
Spallanzani. Les biologistes du XIXe siècle héritèrent des interrogations laissées par ces découvreurs et c'est ainsi qu'Henri Dutrochet ou Claude Bernard – parmi bien d'autres – furent conduits à élaborer une réflexion fondamentale sur la notion de vie.

Les mécanismes moléculaires à l'oeuvre dans ce phénomène seront étudiés au XXe siècle, lequel sera marqué, on le sait, par le développement de certaines applications dont l'une des plus remarquables est sans doute la congélation des
embryons humains. État limite du vivant, la vie latente traverse depuis maintenant trois siècles l'histoire des sciences de la vie. Les questionnements scientifiques et épistémologiques qu'elle provoque, sans cesse renouvelés, sont explorés dans le récit très illustré qu'en donne ici Stéphane Tirard.

L'évolution du vivant

Maryline Coquidé-Cantor, Stéphane Tirard — 2009-03-01T22:05:00Z

L'évolution du vivant est devenue le paradigme central de la biologie et, si les chapitres explicitement consacrés à la théorie de l'évolution dans la scolarité obligatoire ne sont pas si nombreux, elle oriente néanmoins la totalité de l'enseignement des sciences de la vie et de la Terre.

Depuis 1859 les idées darwiniennes ont fait leur chemin, depuis 1953 la génétique et la biologie moléculaire ont donné un support matériel aux phénomènes évolutifs et la théorie n'a cessé de se consolider et s'enrichir. Cependant bien des régressions, des remises en cause, des résistances subsistent ou réapparaissent.

Des enquêtes, menées auprès de publics ayant appris de la biologie au-delà du baccalauréat scientifique, révèlent une grande ignorance ou de graves confusions. Faire face aux offensives des mouvements néo-créationnistes ou du dessein intelligent exige un travail d'épistémologie – auquel les enseignants sont peu préparés – afin d'analyser les raisonnements biaisés qui sont opposés et mettre en place une formation à l'esprit critique où le souci de respect des cultures et des opinions ne conduirait pas à l'esquive ou au renoncement à la rigueur. C'est souvent par un dévoiement des notions de théorie et de « fait » que le doute s'installe dans l'esprit des moins scientifiques ; il est donc essentiel de bien faire comprendre le sens des théories scientifiques et donc la nature même de l'activité scientifique.

Parfois des articles parus dans des revues scientifiques révèlent que des chercheurs reconnus mettent à leur insu dans leurs publications, tantôt du finalisme tantôt un Homo sapiens qui serait au sommet d'une échelle des êtres, espèce élue ! Comme si l'apport de Darwin n'était pas encore complètement assimilé.

Enfin, nous plaçant sur une échelle de temps peu familière, l'idée d'évolution est difficile en elle-même : la métaphore de la parenté sème peut-être de la confusion dans les phylogénies, etc. Bref, l'enseignement de l'évolution est semé d'embûches.

Cet ouvrage collectif analyse la réalité de cet enseignement aujourd'hui, la nature des obstacles didactiques ou socioculturels, rappelle l'apport de la cladistique... afin d'aider les professeurs dans leur tâche ou les étudiants à mieux assimiler la biologie contemporaine.

Bref extrait de la postface de Jean Gayon :

C'est dire l'actualité de la passionnante collection de textes rassemblée par Maryline Coquidé et Stéphane Tirard. C'est en fait tout le volume qu'il faut louer. Jamais sans doute la question de l'enseignement de l'évolution en France n'aura été traitée avec autant de soin dans toutes ses dimensions : programmes d'enseignement (en prenant en compte tous les niveaux de scolarité), difficultés cognitives, conceptuelles, culturelles et pédagogiques de l'enseignement de l'évolution, prise en compte de l'état actuel de la biologie de l'évolution, et questions de société qui ne manquent pas de se poser (importance des contextes nationaux, de la question religieuse, et de l'engagement collectif des enseignants, y compris au niveau syndical). À tous ces égards, le livre est remarquablement documenté, et exemplairement animé par une réflexion critique qui donne le change en comparaison avec la langue de bois trop souvent utilisée dans les déclarations publiques horrifiées sur le sujet, indûment obsédées par la crainte d'une invasion idéologique du créationnisme (dans le genre « Mais comment est-ce possible ? », « Comment a-t-on pu en arriver là ? »). Les auteurs qui ont contribué à ce livre profond et rigoureux sont des praticiens de l'enseignement de l'évolution. Ils donnent un état des lieux, non un état des craintes. Ils parlent de l'enseignement de l'évolution, pas du créationnisme (ou s'ils le font, c'est en ramenant la question sur le terrain didactique et pédagogique). En examinant l'enseignement de l'évolution avec précision sous tous les aspects auxquels ils sont confrontés en pratique, les auteurs renouvellent un débat trop dominé par ce qu'on pourrait appeler la croisade anti-créationniste. Au reste, la dimension de l'enseignement a toujours été un problème capital dans l'histoire de la biologie de l'évolution. Ce n'est sans doute pas tout à fait par hasard que Maryline Coquidé et Stéphane Tirard ont placé en tête du livre, dès la première ligne de leur introduction, le fameux adage de Theodosius Dobzhansky : « Rien en biologie n'a de sens, si ce n'est à la lumière de l'évolution ». On peut rappeler, pour mémoire, que c'est dans une conférence prononcée devant l'association américaine des professeurs de biologie de l'enseignement secondaire que Dobzhansky, deux ans avant sa mort, a inventé cette formule.

On lira l'intégralité de ce texte dans le pdf joint.

Neuroplasticité

Maryline Coquidé-Cantor, Stéphane Tirard — 2007-05-31T22:00:00Z

L'enseignement de la biologie s'est logngtemps appuyé sur une interprétation quelque peu figée de la physiologie nerveuse : strictes localisations des fonctions cérébrales, arrêt précoce (dès l'âge de 2 ans !) de la production de cellules nerveuses, etc.

A l'inverse, on insiste aujourd'hui, au contraire, sur l'extraordinaire plasticité du cerveau : récupérations spectaculaires après certaines lésions, réorganisation d'aires spécialisées lors d'apprentissages "pointus" (l'adaptation des zones de commande de la main chez le violoniste a frappé les esprits), production de nouveaux neurones jusqu'à un âge avancé, etc.

Les théories de l'apprentissage font maintenant référence au darwinisme et, dans les manuels scolaires, on réinterprète les « images scientifiques » les plus classiques. A mesure qu'elle entre dans les programmes, la notion de neuroplasticité bouleverse l'enseignement.

Entre progrès des connaissances et évolution des mentalités, les sciences de la vie ne sont-elles pas appelées à remplir une nouvelle mission dans la formation du citoyen ?

On verra ici que les approches historiques aident à mieux comprendre les avancées scientifiques et les choix pédagogiques qui s'ensuivent. En travaillant, par exemple, sur l'imagerie cérébrale la plus moderne, l'enseignant sera capable d'analyser les relations entre les différentes lectures d'un même document : médicale, technique, scientifique ou pédagogique. Mais les implications sociales du développement des neurosciences sont telles qu'un enseignement classique ne saurait suffire ; aussi proposons-nous quelques pistes pour des débats argumentés avec les lycéens.

L'équipe d'auteurs réunit des chercheurs (neurophysiologie, didactique, épistémologie, histoire des sciences) et des enseignants (IUFM, lycée, collège). En croisant les regards, cet ouvrage donne des clés pour y voir plus clair, pour répondre à l'embarras scientifique des professeurs, pour construire une réflexion cohérente sur la nature et le rôle des sciences expérimentales.

« L'être humain est génétiquement programmé, mais programmé pour apprendre. »

François JACOB (1981)

Ouvrage réalisé avec le concours de :

– Jean-Claude Dupont, historien de la biologie, université de Picardie ;

– Marie-Claire Garnier, professeur de SVT, INRP.

– Jean-Claude Hervé, Inspecteur pédagogique régional honoraire des Sciences de la vie et de la Terre ;

– Yves Kuster, professeur de SVT, IUFM de Bretagne ;

– Véronique Mafféo, docteure en didactique de la biologie ;

– Jean-Louis Martinand, didacticien de sciences et technologie, Ecole normale supérieure de Cachan ;

– Grégoire Molinatti, professeur de SVT, doctorant en médiation des sciences, Muséum national d'histoire naturelle ;

– Michèle Ternaux, professeur de SVT, INRP ;

– François Tilquin, professeur de SVT, INRP ;

– Yves Vilain, professeur de SVT, INRP.

Epidémiologie

Jean-Marc Lange, Maryline Coquidé-Cantor, Stéphane Tirard — 2006-09-30T22:00:00Z

L'enseignant de biologie ne cesse d'être interpellé par ses élèves sur des problèmes relevant de l'épidémiologie, parfois indépendamment des programmes de sa discipline (vaccins, SIDA, obésité, relation entre tabac et cancer etc...) Par ailleurs, quand les médias parlent de principe de précaution, de santé publique ou de sujets plus variés, il ressent la nécessité d'intervenir pour assumer, dans ses classes, ses responsabilités de scientifique et de citoyen-enseignant.

Il est désormais devenu indispensable de comprendre et faire comprendre les démarches de cette science de l'épidémiologie. Cependant les enseignants et autres professionnels impliqués comme les infirmières en milieu scolaire ne sont guère formés. Pourtant, l'épidémiologie constitue une mine de cas à étudier et ce dans diverses disciplines comme en éducation civique, juridique et sociale, en sciences économiques et sociales, en mathématiques et même en philosophie.

Dans cet ouvrage, l'équipe réunie ici, chercheurs en épidémiologie, en didactique, en histoire des sciences, enseignants de biologie en Institut de formation des maîtres, en lycée ou en collège. Elle s'est attachée à relier histoire, concepts et démarches de l'épidémiologie aux enjeux, éthiques, sociaux, de santé ou de formation. En chemin, des études de cas et des applications pédagogiques fournissent ou suggèrent des supports concrets ; les ressources les plus utiles sont recensées. Ceci, afin que chacun se sente mieux armé pour concevoir son propre enseignement, repère mieux les implications de chaque choix opéré, participe à l'évolution d'une discipline, de l'école, d'une société et de ses citoyens.

Revue de presse

La Recherche, n°406, 03/2007

"(Ce) livre (...) s'intéresse particulièrement à (la place de l'épidémiologie) dans l'enseignement en confrontant les expériences des chercheurs et des enseignants."

InterCDI, n°211, 01-02/2008

"(...) Ces sujets concernent les sciences de la vie et de la Terre, mais aussi l'éducation civique, juridique et sociale, les sciences économiques et sociales ou les mathématiques et également l'éthique et la philosophie. Chacun pourra s'appuyer sur ce livre pour concevoir son propre enseignement et ainsi participer à l'évolution d'une discipline, de l'école, de la société et de ses citoyens. (...)"